RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508523.5

GRAMD2B-208, Transcript of GRAM domain containing 2B, human

TSL 3

Gene GRAMD2B, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CHRNB2	P17787	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ART1	P52961	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RHAG	Q02094	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RAB30	Q15771	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523		Q6ZSV7	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SARG	Q9BW04	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TNFSF4	P23510	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TNFSF8	P32971	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC16A2	P36021	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KCNJ4	P48050	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TM4SF4	P48230	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PMS2	P54278	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZP1	P60852	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PKP1	Q13835	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	APAF1	O14727	1248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PMM2	O15305	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GLUD1	P00367	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KLRK1	P26718	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GLUD2	P49448	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF432	O94892	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF12	P17014	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GRK5	P34947	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	HNF4G	Q14541	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MECR	Q9BV79	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms