RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LGSNQ5TDP6 509 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD11Q693B1 232 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FUT10Q6P4F1 479 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LZTR1Q8N653 840 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 STKLD1Q8NE28 680 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TTC17Q96AE7 1141 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A13Q96H72 371 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SERAC1Q96JX3 654 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TEKT5Q96M29 485 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 WDR27A2RRH5 827 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL10P02778 98 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CSH1P0DML2 217 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CSH2P0DML3 217 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PGAM1P18669 254 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCNCP24863 283 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MGAT1P26572 445 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 FPGSQ05932 587 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GPR17Q13304 367 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HHATQ5VTY9 493 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CCT6BQ92526 530 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MTBPQ96DY7 904 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 APOPT1Q96IL0 206 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf74Q96LT6 269 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TSGA13Q96PP4 275 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SYBUQ9NX95 663 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HCSTQ9UBK5 93 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR11A4FU01 709 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA8RI6L899 631 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 LPXNO60711 386 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KRT38O76015 456 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GALTP07902 379 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A3P11169 496 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CPB1P15086 417 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ADRA1DP25100 572 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINB9P50453 376 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NEK3P51956 506 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CRADDP78560 199 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCB1Q12824 385 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RTP2Q5QGT7 225 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CGB2Q6NT52 195 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CASC4Q6P4E1 433 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA17Q96L03 361 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 B3GALT6Q96L58 329 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 AGAP3Q96P47 875 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CASS4Q9NQ75 786 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 GMIPQ9P107 970 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 BPTFQ12830 3046 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 WASH4PA8MWX3 477 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 E9PAM4 449 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 H7C4K7 107 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CACNG3O60359 315 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 UGT1A9O60656 530 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ACRP10323 421 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 PYGBP11216 843 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 ALADP13716 330 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 NFKB1P19838 968 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-208ENST00000502484 CNTFP26441 200 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms