RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TLR2	O60603	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	NFATC1	O95644	943 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CSF1	P09603	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	LYL1	P12980	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284		F8W810	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	WNT1	P04628	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PAX3	P23760	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	AVPR2	P30518	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	MMP13	P45452	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	MAPK9	P45984	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	OAZ1	P54368	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	MIDN	Q504T8	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SYN3	O14994	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CKMT1A	P12532	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP4B1	P13584	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TNNT1	P13805	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	GSTM2	P28161	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CIITA	P33076	1130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	STAT1	P42224	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	GALNT3	Q14435	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TAF12	Q16514	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KAT2A	Q92830	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RHOD	O00212	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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