RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495556.1

TNS1-219, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-219ENST00000495556 HES3Q5TGS1 186 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PMF1Q6P1K2 205 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TMEM270Q6UE05 265 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 STK40Q8N2I9 435 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 FIBINQ8TAL6 211 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ADAM32Q8TC27 787 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TFAP2BQ92481 460 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TTC17Q96AE7 1141 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 NXPE2Q96DL1 559 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SERAC1Q96JX3 654 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 GDF3Q9NR23 364 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 A0A1W2PQ27 194 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 A0A1W2PQ64 194 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 E9PAM4 449 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 GABBR2O75899 941 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ZNF202O95125 648 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 IL1BP01584 269 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 IGLV3-27P01718 113 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SKILP12757 684 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PRCPP42785 496 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PNOCQ13519 176 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 KCNJ12Q14500 433 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SHBQ15464 509 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PKDCCQ504Y2 493 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 DCAF6Q58WW2 860 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 LGI2Q8N0V4 545 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SCML4Q8N228 414 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SAP25Q8TEE9 199 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 IRGQQ8WZA9 623 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 LMLNQ96KR4 655 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SERPINB11Q96P15 392 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ST7Q9NRC1 585 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ITPR1Q14643 2758 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 MYLKQ15746 1914 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 A0A1W2PR77 199 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TLR4O00206 839 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 CAPN9O14815 690 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 YKT6O15498 198 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 CCP110O43303 1012 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ADH1BP00325 375 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 PAEPP09466 180 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 C7P10643 843 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 GOT1P17174 413 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 NNMTP40261 264 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ACADVLP49748 655 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 CCR5P51681 352 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-219ENST00000495556 ADPRHP54922 357 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms