RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CACUL1	Q86Y37	369 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	EMC1	Q8N766	993 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CEP76	Q8TAP6	659 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ALG14	Q96F25	216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SIN3B	O75182	1162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	DNTT	P04053	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TPM4	P67936	248 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327		E9PAM4	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TM4SF5	O14894	197 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CNTN5	O94779	1100 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	KRT3	P12035	628 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NNMT	P40261	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ATP11A	P98196	1134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NR1I3	Q14994	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ALF	Q53S48	1182 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB119	Q8N690	84 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM28-208	ENST00000495327	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	MEI4	A8MW99	385 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	SERPINC1	P01008	464 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	RHOC	P08134	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	SERPINF2	P08697	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	GPD1	P21695	349 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	PRKCI	P41743	596 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	IRX4	P78413	519 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	CST6	Q15828	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	CDO1	Q16878	200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM28-208	ENST00000495327	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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