RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 GOT1P17174 413 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 C5AR1P21730 350 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 CCR5P51681 352 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 SULT2A1Q06520 285 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRN2Q92932 1015 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC6A18Q96N87 628 aa23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GTQ1 180 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 NNMTP40261 264 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMD8P48556 350 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PLK1P53350 603 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 OXCT1P55809 520 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNJ12Q14500 433 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 STK40Q8N2I9 435 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 AADATQ8N5Z0 425 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 EBF2Q9HAK2 575 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 ACP6Q9NPH0 428 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 DKK4Q9UBT3 224 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.27■■□□□ 1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GVM2 712 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 ADPRHP54922 357 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK17Q00537 523 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.27■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 MYLKQ15746 1914 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 BECN2A8MW95 431 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 PDGFRAP16234 1089 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCB4P21439 1286 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CD38P28907 300 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CCR1P32246 355 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 VASPP50552 380 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 MTA1Q13330 715 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF5Q15542 800 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SPAG5Q96R06 1193 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 FTSJ1Q9UET6 329 aa23.26■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 ASXL3Q9C0F0 2248 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 HSF2BPO75031 334 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT1P04628 370 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 IL9RQ01113 521 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GJB7Q6PEY0 223 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 OR14C36Q8NHC7 312 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 MDM1Q8TC05 714 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CPXM1Q96SM3 734 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 DDIT4Q9NX09 232 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.25■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1W2PR77 199 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 YKT6O15498 198 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 IL1BP01584 269 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GBP6Q6ZN66 633 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB106AQ8N104 65 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 FRS2Q8WU20 508 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SHC3Q92529 594 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM131CQ96AQ9 280 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM4CQ9H3R0 1056 aa23.24■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 LATO43561 262 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC9A1P19634 815 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 DRD3P35462 400 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 USP8P40818 1118 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXL22Q6P050 247 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 DSG4Q86SJ6 1040 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF34Q969K3 372 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SERAC1Q96JX3 654 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 NOX5Q96PH1 765 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 GDF3Q9NR23 364 aa23.23■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC7A4O43246 635 aa23.22■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 VAV1P15498 845 aa23.22■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.22■■□□□ 1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.22■■□□□ 1.31
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