RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 AHCYL1O43865 530 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CA3P07451 260 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DESP17661 470 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ADRA1DP25100 572 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CA8P35219 290 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 BCAT1P54687 386 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 LILRA4P59901 499 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MXRA7P84157 204 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NME3Q13232 169 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SPARCL1Q14515 664 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 EFHC2Q5JST6 749 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CGB2Q6NT52 195 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MFN1Q8IWA4 741 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DEFB106AQ8N104 65 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PPM1NQ8N819 430 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ADAM32Q8TC27 787 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB18Q96M61 343 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MED10Q9BTT4 135 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PIRO00625 290 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CYB561D2O14569 222 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ASMTLO95671 621 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GOT1P17174 413 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GRIA1P42261 906 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 POLE2P56282 527 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CUL3Q13618 768 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ITIH4Q14624 930 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PDK2Q15119 407 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 UNC93AQ86WB7 457 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 I3L4J1 428 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CREB3O43889 395 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TBX10O75333 385 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 METTL18O95568 372 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SOD2P04179 222 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 L1CAMP32004 1257 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SULT1E1P49888 294 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 NR1H3Q13133 447 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FUKQ8N0W3 1084 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF560Q96MR9 790 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GAD1Q99259 594 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 LGMNQ99538 433 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TLR9Q9NR96 1032 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.264e-7■□□□□ 10.5
HERC4-211ENST00000492996 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PAK5Q9P286 719 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 M0QZQ0 153 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PTGESO14684 152 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RASSF9O75901 435 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MT-ND3P03897 115 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 INHBAP08476 426 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CNR2P34972 360 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MLH1P40692 756 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DPP6P42658 865 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MAP3K7CLP57077 242 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CRADDP78560 199 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 OVGP1Q12889 678 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ11Q14654 390 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SETDB1Q15047 1291 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TDRPQ86YL5 185 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FITM2Q8N6M3 262 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CCNYQ8ND76 341 aa7.2□□□□□ -1.26
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