RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 HAPLN3Q96S86 360 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TBCBQ99426 244 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SMTNL1A8MU46 457 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRNB2P17787 502 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MAOBP27338 520 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FLT3P36888 993 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 BNIPLQ7Z465 357 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM124AQ86V42 546 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ALG14Q96F25 216 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CACNA1EQ15878 2313 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 DRGXA6NNA5 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TTC34A8MYJ7 566 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ENDOD1O94919 500 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SEMA4FO95754 770 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ACSL1P33121 698 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CENPCQ03188 943 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 C14orf80Q86SX3 495 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MTG2Q9H4K7 406 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 OPHN1O60890 802 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNA4P22459 653 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC14A1Q13336 389 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CST6Q15828 149 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 C2CD6Q53TS8 623 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 GANCQ8TET4 914 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC32A1Q9H598 525 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS28Q9UK41 221 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FZD4Q9ULV1 537 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT83P78385 493 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 SEMA3BQ13214 749 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRN2Q92932 1015 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM129BQ96TA1 746 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO6Q9UM54 1294 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP1-211ENST00000492545 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 I6L893 689 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP9BO43861 1147 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ADH1BP00325 375 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CALB1P05937 261 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP1A3P13637 1013 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C5AR1P21730 350 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SDC4P31431 198 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC8A1P32418 973 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 TRNP1Q6NT89 227 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 OMDQ99983 421 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 MUC3BQ9H195 1237 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms