RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TWNK	Q96RR1	684 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	AGRP	O00253	132 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CLOCK	O15516	846 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	IL10	P22301	178 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	HMOX2	P30519	316 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PTGER2	P43116	358 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	XIAP	P98170	497 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	LPGAT1	Q92604	370 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	USP54	Q70EL1	1684 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292		E7ESA3	106 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CD1E	P15812	388 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	NAMPT	P43490	491 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	BNIP3	Q12983	259 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCLAF	Q15004	111 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FETUB	Q9UGM5	382 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NR5A2	O00482	541 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC3	O15379	428 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	C2	P06681	752 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NFIC	P08651	508 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GOT1	P17174	413 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	UGT1A6	P19224	532 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF460	Q14592	562 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NR1D2	Q14995	579 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEH	Q6S545	545 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	COL18A1	P39060	1754 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GNGT2	O14610	69 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF23	P17027	643 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ADRM1	Q16186	407 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CERS2	Q96G23	380 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GID8	Q9NWU2	228 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	STK32B	Q9NY57	414 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PPW3	197 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	INPP4B	O15327	924 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TFEB	P19484	476 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SULT1E1	P49888	294 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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