RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	VIP	P01282	170 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	POLB	P06746	335 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM225B	P0DP42	221 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	AKR1B1	P15121	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CD19	P15391	556 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	XBP1	P17861	261 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ADRA1D	P25100	572 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CNTF	P26441	200 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MPG	P29372	298 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MTHFS	P49914	203 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PNLIPRP1	P54315	467 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	UBASH3A	P57075	661 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PRKG1	Q13976	671 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	STARD3	Q14849	445 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PPP2R5B	Q15173	497 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ASIC2	Q16515	512 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MEA1	Q16626	185 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ST3GAL2	Q16842	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PFKFB4	Q16877	469 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	LIN54	Q6MZP7	749 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	USP43	Q70EL4	1123 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	NEK8	Q86SG6	692 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	2.77	□□□□□ -1.97	2e-6	■■■□□ 15.3
PUM3-204	ENST00000490444	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM71B	Q8TC56	605 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	STYX	Q8WUJ0	223 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MUL1	Q969V5	352 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	EID2B	Q96D98	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HIC2	Q96JB3	615 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RITA1	Q96K30	269 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MMS19	Q96T76	1030 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CIPC	Q9C0C6	399 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	COMMD8	Q9NX08	183 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MTRR	Q9UBK8	725 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	AASS	Q9UDR5	926 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CEP83	Q9Y592	693 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444		A6NLC8	198 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444		J3KTA2	159 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PPP6C	O00743	305 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ASNA1	O43681	348 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KRT86	O43790	486 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	TNFRSF6B	O95407	300 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	HSPA4L	O95757	839 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	STARD3NL	O95772	234 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	MT-CO3	P00414	261 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ANXA6	P08133	673 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	CYP2D6	P10635	497 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ATP1A3	P13637	1013 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	STMN1	P16949	149 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	KLRK1	P26718	216 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SERPINF1	P36955	418 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	LIFR	P42702	1097 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	PLCD1	P51178	756 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
PUM3-204	ENST00000490444	ARL4C	P56559	192 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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