RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 IL1R2P27930 398 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MIPP30301 263 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PLK1P53350 603 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SCAPQ12770 1279 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PGBD3Q8N328 593 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SUMF1Q8NBK3 374 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OR7D4Q8NG98 312 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FNIP1Q8TF40 1166 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CCDC42Q96M95 316 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OSGEPQ9NPF4 335 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ANAPC7Q9UJX3 599 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TFR2Q9UP52 801 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PLA2G4CQ9UP65 541 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TTC34A8MYJ7 566 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CREB3O43889 395 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SNAP91O60641 907 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RNF8O76064 485 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 H2AFZP0C0S5 128 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 VAV1P15498 845 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 BCKDHBP21953 392 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OR1E1P30953 314 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 COPAP53621 1224 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SEMA3BQ13214 749 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PRR23BQ6ZRT6 265 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 H2AFVQ71UI9 128 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NLRP14Q86W24 1093 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CACUL1Q86Y37 369 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SPC24Q8NBT2 197 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 GAB3Q8WWW8 586 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MRGPRX1Q96LB2 322 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PRSS16Q9NQE7 514 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TMEM51Q9NW97 253 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 DNAI1Q9UI46 699 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.46□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PRR23AA6NEV1 266 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 K7ERQ8 282 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RPP40O75818 363 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MOCS3O95396 460 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MT-CO1P00395 513 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 RHOQP17081 205 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 L1CAMP32004 1257 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ACVRL1P37023 503 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MRE11P49959 708 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ECT2LQ008S8 904 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SLC12A1Q13621 1099 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SMTNL2Q2TAL5 461 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EFHC2Q5JST6 749 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 LINGO4Q6UY18 593 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KBTBD6Q86V97 674 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DCLK2Q8N568 766 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NETO2Q8NC67 525 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MUC3BQ9H195 1237 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EPC1Q9H2F5 836 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 VPS28Q9UK41 221 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 USP18Q9UMW8 372 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CHD5Q8TDI0 1954 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 NPC1O15118 1278 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 SIN3BO75182 1162 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ALDH1A2O94788 518 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ASLP04424 464 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 TMEM253P0C7T8 217 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 EPHB2P29323 1055 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 P2RY2P41231 377 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 GNA12Q03113 381 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-210ENST00000488157 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms