RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 C11orf74Q86VG3 221 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TRIM11Q96F44 468 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 LOXL4Q96JB6 756 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 HINFPQ9BQA5 517 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 RBSNQ9H1K0 784 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MTG2Q9H4K7 406 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SUN2Q9UH99 717 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FAM72CH0Y354 149 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TGM1P22735 817 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ST8SIA6P61647 398 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SULT2A1Q06520 285 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SCAPQ12770 1279 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FAM72BQ86X60 149 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TRIM7Q9C029 511 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CD93Q9NPY3 652 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NENFQ9UMX5 172 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CKAP5Q14008 2032 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF217O75362 1048 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 RHOBTB1O94844 696 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 EPN2O95208 641 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 C7P10643 843 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PSMA2P25787 234 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PMS2CLQ68D20 193 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OR2T3Q8NH03 318 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SPACA7Q96KW9 195 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TRIM5Q9C035 493 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FZD10Q9ULW2 581 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SCINQ9Y6U3 715 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.53■■□□□ 1.04
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ACTB-211ENST00000480301 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MUC3BQ9H195 1237 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 VPS28Q9UK41 221 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NEU3Q9UQ49 428 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MFAP3LO75121 409 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 LRIG2O94898 1065 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 OR1E1P30953 314 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SPEM2Q0P670 501 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 NLRP14Q86W24 1093 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PSMB7Q99436 277 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 THAP2Q9H0W7 228 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 FBRSQ9HAH7 460 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 A0A0D9SEW6 157 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ILVBLA1L0T0 632 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K13O43283 966 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SIN3BO75182 1162 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TPM1P09493 284 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 DESP17661 470 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 L1CAMP32004 1257 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 AIF1P55008 147 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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