RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PMPCBO75439 489 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS6KA4O75676 772 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.381e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRM4P08173 479 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1B1P15313 513 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFBP2P18065 325 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GATA3P23771 443 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 THPOP40225 353 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 NRIP1P48552 1158 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 RBP5P82980 135 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TFCP2Q12800 502 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR162Q16538 588 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2A13Q16696 494 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GJB7Q6PEY0 223 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 MAVSQ7Z434 540 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT7Q86SF2 657 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR149Q86SP6 731 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS52Q8N1B4 723 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL10Q8N8L6 244 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF31Q96EP0 1072 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD1Q96SE0 405 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 C5AR2Q9P296 337 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 FLT1P17948 1338 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GLOD5A6NK44 160 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A4O43246 635 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 HBP1O60381 514 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TACC1O75410 805 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHA1P01876 353 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 RB1P06400 928 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 FESP07332 822 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP3CBP16298 524 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5DP30049 168 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPZA2P47755 286 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCN2P51788 898 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2CBP62714 309 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP2CAP67775 309 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALNT1Q00973 533 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 BFSP1Q12934 665 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXL1Q12952 345 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 IL13RA2Q14627 380 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 KAZNQ674X7 775 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 ADALQ6DHV7 355 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8NFD4 153 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 NEK9Q8TD19 979 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS33AQ96AX1 596 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP7D2Q96T17 732 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 MNTQ99583 582 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 STRA6Q9BX79 667 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX101Q9BY14 249 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC32A1Q9H598 525 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 MTRRQ9UBK8 725 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS4AQ9UN37 437 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms