RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470511.5

PRKCZ-209, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-209	ENST00000470511	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GPR158	Q5T848	1215 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SCML4	Q8N228	414 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RNF139	Q8WU17	664 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	EDEM1	Q92611	657 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PEBP4	Q96S96	227 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ACACA	Q13085	2346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MAP3K13	O43283	966 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RAD51C	O43502	376 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SOAT2	O75908	522 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	KRT10	P13645	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	KDELR1	P24390	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GALK1	P51570	392 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	EPHB3	P54753	998 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	EPHA5	P54756	1037 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	HDAC4	P56524	1084 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	DYNLT1	P63172	113 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	FAM193A	P78312	1265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	DR1	Q01658	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SNX1	Q13596	522 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	DMC1	Q14565	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PDK2	Q15119	407 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TAF12	Q16514	161 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MAP9	Q49MG5	647 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PMS2CL	Q68D20	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MDM1	Q8TC05	714 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RNF34	Q969K3	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	NPY6R	Q99463	290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	STIM2	Q9P246	746 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	MDM4	O15151	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	F9	P00740	461 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	ENG	P17813	658 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	BCKDHB	P21953	392 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-209	ENST00000470511	YWHAQ	P27348	245 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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