RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 KCND2Q9NZV8 630 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SARDHQ9UL12 918 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PKP3Q9Y446 797 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX22C9J3V5 150 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DOK2O60496 412 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PTP4A3O75365 173 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNDBP1O95273 360 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ESRRBO95718 433 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ELFN1P0C7U0 828 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 UBL4AP11441 157 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LAMP2P13473 410 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ALOX12P18054 663 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GJC1P36383 396 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MPLP40238 635 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP4F2P78329 520 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 NUCB1Q02818 461 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DMWDQ09019 674 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MTFR2Q6P444 385 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GJB7Q6PEY0 223 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS52Q8N1B4 723 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP2A3Q93084 1043 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 C5orf34Q96MH7 638 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.68e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-207ENST00000470201 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM2Q9C040 744 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHX3Q9H6B9 360 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 BRF2Q9HAW0 419 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ASIC5Q9NY37 505 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MCIDASD6RGH6 385 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CLIC1O00299 241 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DSCR3O14972 297 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PER2O15055 1255 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HBP1O60381 514 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TMCC2O75069 709 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ADH4P08319 380 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TGM2P21980 687 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTM2P28161 218 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCD1P33897 745 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ADRA1BP35368 520 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 BSGP35613 385 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MLH1P40692 756 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RGS2P41220 211 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RAD52P43351 418 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MTNR1AP48039 350 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS41P49754 854 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF84P51523 738 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ADPRHP54922 357 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 EFEMP1Q12805 493 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXE3Q13461 319 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MAMLD1Q13495 774 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNG2Q16589 344 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 VSTM1Q6UX27 236 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC9A6Q92581 669 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CAVIN3Q969G5 261 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SAAL1Q96ER3 474 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 GHITMQ9H3K2 345 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 MPP6Q9NZW5 540 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS28Q9UK41 221 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 BTBD19C9JJ37 291 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 H7C1Q1 480 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-207ENST00000470201 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms