RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 NUMBP49757 651 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 SCAPQ12770 1279 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 NUP85Q9BW27 656 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM7Q9C029 511 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM245Q9H330 911 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 VPS28Q9UK41 221 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 FZD10Q9ULW2 581 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 INVSQ9Y283 1065 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-202ENST00000460308 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PRPSAP2O60256 369 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 L1CAMP32004 1257 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ACAP1Q15027 740 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 LPAL2Q16609 132 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF366Q8N895 744 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SPACA7Q96KW9 195 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 HINFPQ9BQA5 517 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 EML5Q05BV3 1969 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CREB3O43889 395 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 LRIG2O94898 1065 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 H2AFZP0C0S5 128 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RHOQP17081 205 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 NDUFV2P19404 249 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 KRT83P78385 493 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ERMARDQ5T6L9 678 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 H2AFVQ71UI9 128 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 C11orf74Q86VG3 221 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 TC2NQ8N9U0 490 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 KDM1BQ8NB78 822 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 OR52K2Q8NGK3 314 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RLN3Q8WXF3 142 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 EPAS1Q99814 870 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CD248Q9HCU0 757 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 NCDNQ9UBB6 729 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 IP6K2Q9UHH9 426 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 GMEB2Q9UKD1 530 aa22■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ILVBLA1L0T0 632 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 FAM72CH0Y354 149 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MYO1FO00160 1098 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 DCLK1O15075 740 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MAP3K13O43283 966 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF217O75362 1048 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MANEALQ5VSG8 457 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 FAM72BQ86X60 149 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 OR2T3Q8NH03 318 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ALG14Q96F25 216 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 NENFQ9UMX5 172 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CKAP5Q14008 2032 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 EPHB2P29323 1055 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MIPP30301 263 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ELF2Q15723 593 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 KBTBD6Q86V97 674 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RUBCNQ92622 972 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SPON2Q9BUD6 331 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 FBRSQ9HAH7 460 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 TTC34A8MYJ7 566 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCD4-202ENST00000460308 RHOBTB1O94844 696 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms