RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-222	ENST00000459758	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-222	ENST00000459758	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-222	ENST00000459758	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-222	ENST00000459758	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0G2JND7	137 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR91	A4D1P6	747 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	OR6C75	A6NL08	312 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PGK1	P00558	417 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CSH1	P0DML2	217 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CSH2	P0DML3	217 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	BGN	P21810	368 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	BDNF	P23560	247 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TYK2	P29597	1187 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CD52	P31358	61 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	GRIK1	P39086	918 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	LPIN1	Q14693	890 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	RBBP8	Q99708	897 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CARNS1	A5YM72	827 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNG3	O60359	315 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	LRIG2	O94898	1065 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	OAZ2	O95190	189 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL2	O95198	593 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINE1	P05121	402 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NDST2	P52849	883 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	LIMK2	P53671	638 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NRL	P54845	237 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NOG	Q13253	232 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CHI3L2	Q15782	390 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	LPP	Q93052	612 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TLE6	Q9H808	572 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758		H7C4K7	107 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	MATN3	O15232	486 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	POMC	P01189	267 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms