RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 FMO2Q99518 471 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FUT8Q9BYC5 575 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DRGXA6NNA5 263 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 XYLBO75191 536 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PRAMEF12O95522 483 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 WASHC5Q12768 1159 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ADGRF1Q5T601 910 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CPT1BQ92523 772 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 WHRNQ9P202 907 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF103O00237 685 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOQP17081 205 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HOXA9P31269 272 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SERPINB6P35237 376 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB17Q13105 803 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HMCESQ96FZ2 354 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PLK2Q9NYY3 685 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LEFTY2O00292 366 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 BANF1O75531 89 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ITIH2P19823 946 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 OR1E1P30953 314 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HYAL1Q12794 435 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 GPS2Q13227 327 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF576Q9H609 170 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0D9SEW6 157 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ERICH4A6NGS2 130 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ACVRL1P37023 503 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC7A9P82251 487 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF567Q8N184 647 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RTP4Q96DX8 246 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PRO3102Q9H379 93 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 J3KR12 359 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AVPR1AP37288 418 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CASP8Q14790 479 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP9Q49MG5 647 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 Q6ZNB5 142 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AGAP3Q96P47 875 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MAFKO60675 156 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM63AO94886 807 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AFMIDQ63HM1 303 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HDAC11Q96DB2 347 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 WASH4PA8MWX3 477 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HACD1B0YJ81 288 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 JCHAINP01591 159 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN3P26045 913 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 EMBQ6PCB8 327 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TASP1Q9H6P5 420 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP69A5D8W1 941 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RASA4BC9J798 803 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RASA4O43374 803 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 HTR7P34969 479 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 OLIG2Q13516 323 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CAVIN3Q969G5 261 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM51Q9NW97 253 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 C5orf60A6NFR6 353 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 GCATO75600 419 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTN2P35609 894 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms