RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ATCAYQ86WG3 371 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MFN1Q8IWA4 741 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF276Q8N554 614 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 OR13H1Q8NG92 308 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NOX5Q96PH1 765 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PANK4Q9NVE7 773 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PISDQ9UG56 409 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MYH10P35580 1976 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CLIC2O15247 247 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MTSS1O43312 755 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 STX6O43752 255 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TCEA3O75764 348 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ASLP04424 464 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 JMJD7P0C870 316 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 COL8A1P27658 744 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 DRD3P35462 400 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NUDT1P36639 197 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CASP4P49662 377 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 POLE2P56282 527 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ANAPC15P60006 121 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.221e-6■■■□□ 19.2
HDLBP-222ENST00000449504 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CYP24A1Q07973 514 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PSMD6Q15008 389 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NR0B2Q15466 257 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ADGRF1Q5T601 910 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 BORAQ6PGQ7 559 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SV2BQ7L1I2 683 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SPATA20Q8TB22 786 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PTPRN2Q92932 1015 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TTC17Q96AE7 1141 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 EPSTI1Q96J88 318 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 IL12RB2Q99665 862 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 USP3Q9Y6I4 520 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NOTCH2Q04721 2471 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQU0 124 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SLFN14P0C7P3 912 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 P4HA1P13674 534 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 VAV1P15498 845 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ITIH1P19827 911 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 AKT2P31751 481 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PDX1P52945 283 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF445P59923 1031 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CNTN1Q12860 1018 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NCOA4Q13772 614 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FHL5Q5TD97 284 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 Q6ZSR6 202 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 UNC93AQ86WB7 457 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM69Q86WT6 500 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FIBINQ8TAL6 211 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LMX1AQ8TE12 382 aa7.43□□□□□ -1.22
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