RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 EFEMP1Q12805 493 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PKP1Q13835 747 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-BQ31612 363 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF394Q53GI3 561 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CEP135Q66GS9 1140 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 LAYNQ6UX15 382 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PDZD3Q86UT5 571 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FAM124AQ86V42 546 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 DENND1CQ8IV53 801 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF366Q8N895 744 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA4DQ92854 862 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MYO19Q96H55 970 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CRELD1Q96HD1 420 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 DUSP16Q9BY84 665 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM131Q92545 1883 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SLC12A8A0AV02 714 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PDXKO00764 312 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 IKBKBO14920 756 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN3O60637 253 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KIF20AO95235 890 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SLFN14P0C7P3 912 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF883P0CG24 379 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 P4HA1P13674 534 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ACSL1P33121 698 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MATKP42679 507 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SGSHP51688 502 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 VAMP7P51809 220 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 STARD3Q14849 445 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KIF19Q2TAC6 998 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RAB41Q5JT25 222 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ACAD11Q709F0 780 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PIGZQ86VD9 579 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CPXM2Q8N436 756 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 EXOC1Q9NV70 894 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ITPR1Q14643 2758 aa6.84□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAM149AA5PLN7 773 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 F13A1P00488 732 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 EPHX1P07099 455 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RALAP11233 206 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-FP30511 346 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 OXTRP30559 389 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CHKAP35790 457 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ME1P48163 572 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF132P52740 706 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RAD23BP54727 409 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 COG7P83436 770 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MSMPQ1L6U9 139 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ARID3AQ99856 593 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 NUP58Q9BVL2 599 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms