RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TPSB2P20231 275 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 OR1E1P30953 314 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 IRS1P35568 1242 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 AVPR1AP37288 418 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 KCNQ1P51787 676 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TNK2Q07912 1038 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 IL10RBQ08334 325 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SLC12A1Q13621 1099 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TRADDQ15628 312 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TPSAB1Q15661 275 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TXNDC8Q6A555 127 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf80Q86SX3 495 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CHSY1Q86X52 802 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 DENND1CQ8IV53 801 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 LGI2Q8N0V4 545 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RUFY1Q96T51 708 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HINFPQ9BQA5 517 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 PPCSQ9HAB8 311 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 PIDD1Q9HB75 910 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 GKN1Q9NS71 199 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MYO9BQ13459 2157 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEB16A2A368 324 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 E7EVH7 732 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 H0YGN5 161 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CACNG3O60359 315 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAFKO60675 156 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RAMP2O60895 175 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SPAG6O75602 509 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA9O76027 345 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 KLKB1P03952 638 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CYBBP04839 570 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CKMP06732 381 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RHOP08100 348 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FAM153BP0C7A2 387 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MYBL2P10244 700 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CCNB1P14635 433 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 GDF10P55107 478 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA5AQ13591 1074 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 KCNC3Q14003 757 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FAM153CQ494X1 144 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MPPE1Q53F39 396 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ARTNQ5T4W7 220 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 GPR158Q5T848 1215 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZNB5 142 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00523Q86TU6 105 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CPT1BQ92523 772 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 MAML1Q92585 1016 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 E2F7Q96AV8 911 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 TEKT5Q96M29 485 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 11.3
HDLBP-211ENST00000425989 LGMNQ99538 433 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-211ENST00000425989 IL12RB2Q99665 862 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms