RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF6Q58WW2 860 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CATSPER4Q7RTX7 472 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC93AQ86WB7 457 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF567Q8N184 647 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PHTF2Q8N3S3 785 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIB2Q92519 343 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CERS2Q96G23 380 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM12Q9H4Q4 367 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 EBF3Q9H4W6 596 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX15Q9NRS6 342 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF195O14628 629 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 POLBP06746 335 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSHP09668 335 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CPA3P15088 417 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 POLE2P56282 527 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF111Q6ZNA4 994 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB107AQ8IZN7 70 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 BEST2Q8NFU1 509 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AGR3Q8TD06 166 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AZIN2Q96A70 460 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK1O00180 336 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DCXO43602 365 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 F2P00734 622 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GP5P40197 560 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNIQ14094 377 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 LPCAT4Q643R3 524 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 STRADAQ7RTN6 431 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PID1Q7Z2X4 250 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DHDDSQ86SQ9 333 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DCLK2Q8N568 766 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF139Q8WU17 664 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX27Q96L92 541 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GBP5Q96PP8 586 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH22Q9UJ99 828 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MX2P20592 715 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS2P41220 211 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MATKP42679 507 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FLT3LGP49771 235 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCZQ05513 592 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CUL3Q13618 768 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf57Q5W0N0 161 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AAGABQ6PD74 315 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PDP2Q9P2J9 529 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GARSP41250 739 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 INSCQ1MX18 579 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HPS6Q86YV9 775 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PBE3 544 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL41O60662 606 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PSEN2P49810 448 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SATB1Q01826 763 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ADIGQ0VDE8 80 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NAB1Q13506 487 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GNASQ5JWF2 1037 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC52Q8N7C0 313 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF781Q8N8C0 355 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6Y1Q8NGX8 325 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTM5Q96DZ9 223 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 APBA2Q99767 749 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FERMT1Q9BQL6 677 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NAT9Q9BTE0 207 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF3CO14782 793 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGAXP20702 1163 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HARS2P49590 506 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NME3Q13232 169 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DLG2Q15700 870 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB6Q15916 424 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A52Q3SY17 297 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP157Q5JU67 520 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 STRA8Q7Z7C7 330 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTRT2Q8TDY3 377 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R3CQ969Q6 453 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP2Q99490 1192 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3GL3Q99963 347 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 COG4Q9H9E3 785 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CAB39LQ9H9S4 337 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTLC1O15269 473 aa19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms