RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRC5Q86WI3 1866 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCNX2A6NKB5 2137 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS38A1L453 326 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPPA5A6NC42 116 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF785A8K8V0 405 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHODO00212 210 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPRIN2O60269 458 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBR3O75828 277 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENDOD1O94919 500 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHEK2O96017 543 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFRCP02786 760 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 APPP05067 770 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNMTP11086 282 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOLR2P14207 255 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAGAP17050 411 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRNB2P17787 502 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELK1P19419 428 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCL3P20749 454 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHATP28329 748 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMD8P48556 350 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC63Q05C16 580 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALCRLQ16602 461 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC27A1Q6PCB7 646 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSG4Q86SJ6 1040 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL17RDQ8NFM7 739 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TM9SF4Q92544 642 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KAT2BQ92831 832 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP7Q93009 1102 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAMP4Q969E2 229 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYFIP2Q96F07 1278 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCANQ96GW7 911 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGSM3Q96HU1 749 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEH1Q9H213 219 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LPAR3Q9UBY5 353 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB26Q9ULW5 256 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC45A2Q9UMX9 530 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CGNL1Q0VF96 1302 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JLW4 131 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 B2RBV5 119 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMD9O00233 223 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 F2RL2O00254 374 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRM6O15303 877 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMPRSS11DO60235 418 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDKP21741 143 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNLYP22749 145 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL4RP24394 825 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FASP25445 335 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AXLP30530 894 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIITAP33076 1130 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXD12P35452 270 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX5P35711 763 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX9P48436 509 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE6CP51160 858 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MECP2P51608 486 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLE2P56282 527 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP8B2P98198 1209 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCF15Q12870 199 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPRNQ4KMQ1 711 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP40Q5TG30 622 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRGCQ6NXR0 463 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRIG3Q6UXM1 1119 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEPD1Q7L9B9 569 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf96Q7Z7L8 435 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGBD5Q8N414 524 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD177Q8N6Q3 437 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUMF1Q8NBK3 374 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFWD2Q8NHY2 731 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 OSCP1Q8WVF1 389 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHDQ96IW2 340 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF354BQ96LW1 612 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC14Q96N46 770 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SENP7Q9BQF6 1050 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTDSS2Q9BVG9 487 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMAT4Q9H898 229 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms