RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ERCC2P18074 760 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1C1P21283 382 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PTPN3P26045 913 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PGM1P36871 562 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 NPY2RP49146 381 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 PDE1BQ01064 536 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SCML4Q8N228 414 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 IRGQQ8WZA9 623 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 C20orf27Q9GZN8 174 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 B2RBV5 119 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CLDN5O00501 218 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CAPN9O14815 690 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 ACADSP16219 412 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A6P48664 564 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 KCTD11Q693B1 232 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 RASSF3Q86WH2 238 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 OR6Y1Q8NGX8 325 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 CDH9Q9ULB4 789 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-205ENST00000409985 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PSMD3O43242 534 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB6P35237 376 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 VHLP40337 213 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 HADHAP40939 763 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NDUFV1P49821 464 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TPI1P60174 286 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NME3Q13232 169 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PCLAFQ15004 111 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TREML1Q86YW5 311 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 MIEF2Q96C03 454 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SENP8Q96LD8 212 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 KRT82Q9NSB4 513 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 RNF19AQ9NV58 838 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 MPOP05164 745 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB8P50452 374 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K7CLP57077 242 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 GALNT2Q10471 571 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 FAM35AQ86V20 835 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 UNC5BQ8IZJ1 945 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 RBBP8Q99708 897 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SYT15Q9BQS2 421 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 GBA3Q9H227 469 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SPC25Q9HBM1 224 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 CHST12Q9NRB3 414 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NRP1O14786 923 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TM7SF2O76062 418 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PSMG1O95456 288 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 PAX3P23760 479 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TYK2P29597 1187 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 LIMK2P53671 638 aa24.31■■□□□ 1.48
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PMS1-205ENST00000409985 SLC34A1Q06495 639 aa24.31■■□□□ 1.48
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PMS1-205ENST00000409985 BEND5Q7L4P6 421 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 ARMCX1Q9P291 453 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 COPG2Q9UBF2 871 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 LTFP02788 710 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 TUBB3Q13509 450 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 NAA25Q14CX7 972 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.3■■□□□ 1.48
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