RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF410Q86VK4 478 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 WDR49Q8IV35 697 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C7orf31Q8N865 590 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RNF149Q8NC42 400 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LMO3Q8TAP4 145 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NT5C1BQ96P26 610 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FNBP1Q96RU3 617 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 WDR24Q96S15 920 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TMEM209Q96SK2 561 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GPR88Q9GZN0 384 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CD248Q9HCU0 757 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 INTUQ9ULD6 942 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 USP18Q9UMW8 372 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ACKR2O00590 384 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC30A4O14863 429 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 OGTO15294 1046 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FAM189A1O60320 539 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TACC1O75410 805 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA1P43355 309 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MFAP3P55082 362 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PTENP60484 403 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TUBB4BP68371 445 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SHC2P98077 582 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CDC42EP1Q00587 391 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DRP2Q13474 957 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SERINC3Q13530 473 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FXNQ16595 210 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZACNQ401N2 412 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC35F6Q8N357 371 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CEP112Q8N8E3 955 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MNS1Q8NEH6 495 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SHC3Q92529 594 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NLRP4Q96MN2 994 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SYT11Q9BT88 431 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FZD8Q9H461 694 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 COL4A3Q01955 1670 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TENM4Q6N022 2769 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 HIDE1A8MVS5 230 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TAF4O00268 1085 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ENPP3O14638 875 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CLDN3O15551 220 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CYP7B1O75881 506 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 IL18RAPO95256 599 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 EDN1P05305 212 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MCF2P10911 925 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PIK3CAP42336 1068 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PDE6CP51160 858 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CLCN3P51790 818 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 APBA1Q02410 837 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms