RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ATP2A3Q93084 1043 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RILPQ96NA2 401 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SNX15Q9NRS6 342 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 MGEA5O60502 916 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 PROCP04070 461 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ARRB2P32121 409 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SLC1A6P48664 564 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CXCR3P49682 368 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 GALNT2Q10471 571 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 TEX9Q8N6V9 391 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CASS4Q9NQ75 786 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 BFARQ9NZS9 450 aa22.1■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RNF34Q969K3 372 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 HDAC11Q96DB2 347 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 EPAS1Q99814 870 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CPNE1Q99829 537 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC78A2IDD5 438 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 B3GAT3O94766 335 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 JCHAINP01591 159 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 PCSK1P29120 753 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 KDSRQ06136 332 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 USP33Q8TEY7 942 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.09■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 B2RBV5 119 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 NCAM2O15394 837 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CD52P31358 61 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 DLG2Q15700 870 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM135Q86UB9 458 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 TNS4Q8IZW8 715 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RBBP8Q99708 897 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 RAD54BQ9Y620 910 aa22.08■■□□□ 1.13
C10orf55-201ENST00000409178 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 F8W810 466 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGAP8P85298 464 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 GRTP1Q5TC63 336 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 RSPH3Q86UC2 560 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.08■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 NUP205Q92621 2012 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 F9P00740 461 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 MX2P20592 715 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 CCNG1P51959 295 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 CHST12Q9NRB3 414 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 PNPOQ9NVS9 261 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 COPG2Q9UBF2 871 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ODC1P11926 461 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 IRF9Q00978 393 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 MAVSQ7Z434 540 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 SORT1Q99523 831 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 SIK2Q9H0K1 926 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 YY1AP1Q9H869 796 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 KRT36O76013 467 aa22.06■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 USP1O94782 785 aa22.06■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 SERPINE1P05121 402 aa22.06■■□□□ 1.12
C10orf55-201ENST00000409178 CDC25CP30307 473 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms