RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 UNC45BQ8IWX7 931 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 APCDD1Q8J025 514 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP52Q8N1V2 620 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 UBA3Q8TBC4 463 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 THSD1Q9NS62 852 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK13O15264 365 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 LCP1P13796 627 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NUMBP49757 651 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 STK19P49842 368 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TBX4P57082 545 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 HS1BP3Q53T59 392 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NUGGCQ68CJ6 796 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 AZIN2Q96A70 460 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM4Q9C037 500 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CEP83Q9Y592 693 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 GABBR2O75899 941 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CDH18Q13634 790 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TTC39CQ8N584 583 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 APOLD1Q96LR9 279 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM8AQ9HCN3 771 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 EXOC1Q9NV70 894 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 IL17BQ9UHF5 180 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SARDHQ9UL12 918 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SATB2Q9UPW6 733 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3R2O00459 728 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CALUO43852 315 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 THEGLP0DJG4 465 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT1P36639 197 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SKOR1P84550 965 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KCNMA1Q12791 1236 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF6Q58WW2 860 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM69Q86WT6 500 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD13Q8WZ19 329 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MYOCQ99972 504 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 ABCG4Q9H172 646 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CNGB3Q9NQW8 809 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL11Q9NVR0 708 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 HESX1Q9UBX0 185 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SERTAD1Q9UHV2 236 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 U3KQA8 63 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PIAS2O75928 621 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MOCS3O95396 460 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KRT13P13646 458 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NFATC3Q12968 1075 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 ISXQ2M1V0 245 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KRT39Q6A163 491 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 IGF2-ASQ6U949 168 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 FAM186BQ8IYM0 893 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SCML4Q8N228 414 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 EXD3Q8N9H8 876 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 KLK6Q92876 244 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 FAXDC2Q96IV6 333 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SPTA1P02549 2419 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A4O43246 635 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 YEATS4O95619 227 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 GP1BAP07359 652 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 NR2F2P24468 414 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 RGS7P49802 495 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CNTN1Q12860 1018 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SGO2Q562F6 1265 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 AGBL4Q5VU57 503 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC81Q6ZN84 652 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK15Q8TD08 544 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC4CQ8WTT0 213 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 FRS2Q8WU20 508 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SLC46A1Q96NT5 459 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG5Q96R06 1193 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 RAB20Q9NX57 234 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PMS2P1A4D2B8 440 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SLC31A1O15431 190 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CD19P15391 556 aa19.89■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 TGM2P21980 687 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms