RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 THP07101 528 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 USP17L7P0C7H9 530 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ATP12AP54707 1039 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DGUOKQ16854 277 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 KRT78Q8N1N4 520 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF276Q8N554 614 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 NDNQ99608 321 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 GLRA2P23416 452 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO21O94952 628 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MED26O95402 600 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 INSRRP14616 1297 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PFKFB4Q16877 469 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ALLCQ8N6M5 410 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 HGH1Q9BTY7 390 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.51■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC6A3Q01959 620 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PDK4Q16654 411 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 LPCAT4Q643R3 524 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MREGQ8N565 214 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SYT15Q9BQS2 421 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP7B1O75881 506 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SERHLQ9NQF3 203 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 RRN3Q9NYV6 651 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SNTNA6NMZ2 147 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP1A2P05177 515 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 HOXD10P28358 340 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 FSTL1Q12841 308 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 INVSQ9Y283 1065 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DEPDC5O75140 1603 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ADCY6O43306 1168 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PEX11AO75192 247 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 OR1E1P30953 314 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC39Q96DD0 335 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 DIP2AQ14689 1571 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 TALDO1P37837 337 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 FOLH1Q04609 750 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 C11orf88Q6PI97 169 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 HAS1Q92839 578 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.5■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 EPHA3P29320 983 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 NR1D2Q14995 579 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SPATA20Q8TB22 786 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 BTRCQ9Y297 605 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 TAF4O00268 1085 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SLURP2P0DP57 97 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKCIP41743 596 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 GRIA4P48058 902 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 GRIK3Q13003 919 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.49■□□□□ 0.07
PTGFRN-201ENST00000393203 SVOPQ8N4V2 548 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.4 ms