RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 C1QTNF9P0C862 333 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CPEP16870 476 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SPINK2P20155 84 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 NEK3P51956 506 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF132P52740 706 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 BCAT1P54687 386 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 MORC3Q14149 939 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM215Q68D42 235 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 DENND1CQ8IV53 801 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CEP76Q8TAP6 659 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 GSDMAQ96QA5 445 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 RMND1Q9NWS8 449 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZZEF1O43149 2961 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 THADAQ6YHU6 1953 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.27□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CACNA1EQ15878 2313 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SLC12A8A0AV02 714 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 E7ENQ6 273 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO24O75426 580 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 GJB3O75712 270 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 IGLV3-19P01714 112 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 PRKCHP24723 683 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CD6P30203 668 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 COPAP53621 1224 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC63Q05C16 580 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ADIGQ0VDE8 80 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF234Q14588 700 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 STARD3Q14849 445 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SGO2Q562F6 1265 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 PASD1Q8IV76 773 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SCML4Q8N228 414 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 GATA6Q92908 595 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 PLD4Q96BZ4 506 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.26□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 IGF2RP11717 2491 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 KCNJ18B7U540 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 PMM2O15305 246 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TIMM44O43615 452 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CYBBP04839 570 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SETSIPP0DME0 302 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 VDRP11473 427 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 NCAM1P13591 858 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CD59P13987 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CD19P15391 556 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 HLA-FP30511 346 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SLC8A3P57103 927 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 DAOAP59103 153 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ICE2Q659A1 982 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TFAP2BQ92481 460 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 TSG101Q99816 390 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 CDH19Q9H159 772 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 SLC32A1Q9H598 525 aa7.25□□□□□ -1.25
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms