RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372108.9

GTF3C5-204, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C5, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-204ENST00000372108 GJB5O95377 273 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FGBP02675 491 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 MLNP12872 115 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 LSP1P33241 339 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PPM1AP35813 382 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KCNQ1P51787 676 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RASA2Q15283 850 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FBXL22Q6P050 247 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 LRRC31Q6UY01 552 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CNTD1Q8N815 330 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 BADQ92934 168 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 IGSF8Q969P0 613 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TEKT5Q96M29 485 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 GBA3Q9H227 469 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 SPAG6O75602 509 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FGF18O76093 207 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RHOQP17081 205 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ALFQ53S48 1182 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.95■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 DRGXA6NNA5 263 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PRRG1O14668 218 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TEX28O15482 410 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 COCHO43405 550 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CPP00450 1065 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 C1QAP02745 245 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CCNB1P14635 433 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CHN1P15882 459 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.146e-7■■■□□ 17.7
GTF3C5-204ENST00000372108 SPARCL1Q14515 664 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 HECTD3Q5T447 861 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CYTH2Q99418 400 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FNIP2Q9P278 1114 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 MATN3O15232 486 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 AP2A1O95782 977 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 NFKB1P19838 968 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TWF1Q12792 350 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PLD1Q13393 1074 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 OLIG2Q13516 323 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KCTD11Q693B1 232 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 GPR65Q8IYL9 337 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FIBCD1Q8N539 461 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 USP33Q8TEY7 942 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 PAFAH2Q99487 392 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ZBP1Q9H171 429 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RASA4BC9J798 803 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 RASA4O43374 803 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 SUN1O94901 812 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ELF1P32519 619 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 NDST2P52849 883 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 FPGSQ05932 587 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TAF12Q16514 161 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 TRABD2AQ86V40 505 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.93■□□□□ 0.14
GTF3C5-204ENST00000372108 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms