RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 KLQ9UEF7 1012 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT1P04628 370 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CKMT1AP12532 417 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 MIDNQ504T8 468 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 KLBQ86Z14 1044 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT2AQ92830 837 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 VOPP1Q96AW1 172 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 IL21RQ9HBE5 538 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 NOD2Q9HC29 1040 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 THAP1Q9NVV9 213 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CXorf65A6NEN9 183 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 F8W810 466 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 NFATC1O95644 943 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ARSAP15289 507 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 LMO1P25800 156 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP13P45452 471 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 MVDP53602 400 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RHAGQ02094 409 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB16Q05516 673 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf25Q5T742 122 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF144BQ7Z419 303 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS52Q8N1B4 723 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TWNKQ96RR1 684 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL15Q9NXU5 204 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 DPPA5A6NC42 116 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SYN3O14994 580 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP4B1P13584 511 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTM2P28161 218 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 STAT1P42224 750 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS6KA3P51812 740 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 OAZ1P54368 228 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC12A1Q13621 1099 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT3Q14435 633 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 GXYLT1Q4G148 440 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 CPOQ8IVL8 374 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 HERVK_113Q902F9 699 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 MASTLQ96GX5 879 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 Q9N2J8 555 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 RRN3Q9NYV6 651 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-202ENST00000370826 PCSK5Q92824 1860 aa4.24□□□□□ -1.73
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