RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368045.3

CD48-201, Transcript of CD48 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD48, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48-201ENST00000368045 GABRDO14764 452 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PSMD3O43242 534 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 FAM200BP0CF97 657 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ERCC2P18074 760 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CYP2B6P20813 491 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 DNAJB1P25685 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TPI1P60174 286 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 XIAPP98170 497 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 NME3Q13232 169 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ITGA9Q13797 1035 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SNX17Q15036 470 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PPM1JQ5JR12 505 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 HDAC11Q96DB2 347 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TINF2Q9BSI4 451 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CEP41Q9BYV8 373 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CDH19Q9H159 772 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 S100A14Q9HCY8 104 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 KLK14Q9P0G3 267 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PDP2Q9P2J9 529 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.61□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PDHXO00330 501 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 F9P00740 461 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SERPINB6P35237 376 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 NUMBP49757 651 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TKTL1P51854 596 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GALNT2Q10471 571 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 EPGNQ6UW88 154 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 UCMAQ8WVF2 138 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ECSITQ9BQ95 431 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 MED10Q9BTT4 135 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ASB3Q9Y575 518 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PLXNB2O15031 1838 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 KCNK1O00180 336 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TRIM13O60858 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 HSPA4LO95757 839 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PSEN1P49768 467 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 DAOAP59103 153 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SLC25A3Q00325 362 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ZNF33AQ06730 810 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CFAP157Q5JU67 520 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GPR142Q7Z601 462 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 IL22Q9GZX6 179 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 COX16Q9P0S2 106 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 A0A096LPK6 155 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 MEI4A8MW99 385 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 G3V2L1 256 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CLDN5O00501 218 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 SLC22A2O15244 555 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 BEST1O76090 585 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 FYNP06241 537 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ARRB2P32121 409 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 NDUFV1P49821 464 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ADAM17P78536 824 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 MPP3Q13368 585 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CES3Q6UWW8 571 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 IFT43Q96FT9 208 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 TTC1Q99614 292 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 EPAS1Q99814 870 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 RTKNQ9BST9 563 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 RNF39Q9H2S5 420 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.59□□□□□ -0.07
CD48-201ENST00000368045 IPPQ9Y573 584 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms