RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATS1Q496A3 300 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTFR2Q6P444 385 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 GJB7Q6PEY0 223 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM72Q6ZMU5 477 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCDC5Q6ZRR9 648 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF144BQ7Z419 303 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 MDGA2Q7Z553 956 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 PXKQ7Z7A4 578 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM200AQ86VY9 491 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFX6Q8HWS3 928 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 VRK3Q8IV63 474 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADSSL1Q8N142 457 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 VPS52Q8N1B4 723 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NGEFQ8N5V2 710 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 METTL6Q8TCB7 284 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCSTNQ92542 709 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC9A6Q92581 669 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 P2RY11Q96G91 374 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 HS6ST2Q96MM7 605 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP4F11Q9HBI6 524 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASNSD1Q9NWL6 643 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCND2Q9NZV8 630 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 UPB1Q9UBR1 384 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR34Q9UPC5 381 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIAS3Q9Y6X2 628 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL4A3Q01955 1670 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEX22C9J3V5 150 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTBD19C9JJ37 291 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 MGST3O14880 152 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 DSCR3O14972 297 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 LDLRAD4O15165 306 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TGFB1I1O43294 461 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 NARSO43776 548 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SGPL1O95470 568 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRM4P08173 479 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP2D6P10635 497 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACADMP11310 421 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBL4AP11441 157 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAKP20794 623 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TGM2P21980 687 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 GSTM2P28161 218 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TYK2P29597 1187 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAPK4P31152 587 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 IDUAP35475 653 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 OAZ1P54368 228 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC14A1Q13336 389 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBLN7Q53RD9 439 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 AWAT1Q58HT5 328 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 HECTD2Q5U5R9 776 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGFL4Q6B9Z1 124 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP85Q6P2H3 762 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM65Q6PI78 240 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 VSTM1Q6UX27 236 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q6ZPA2 131 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRED1Q7Z699 444 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPLX4Q7Z7G2 160 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 RASAL3Q86YV0 1011 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 SETD9Q8NE22 299 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR52N4Q8NGI2 321 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms