RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356940.10

RAB18-201, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB18, Length 4,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18-201ENST00000356940 NFYCQ13952 458 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SCARA3Q6AZY7 606 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 COPS5Q92905 334 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 P2RY11Q96G91 374 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 POMKQ9H5K3 350 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CAB39LQ9H9S4 337 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 NDFIP2Q9NV92 336 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TJP2Q9UDY2 1190 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 BNIP3LO60238 219 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TPSB2P20231 275 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 FASP25445 335 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PEX2P28328 305 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ACTR3P61158 418 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 MOGSQ13724 837 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TPSAB1Q15661 275 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 GALNT15Q8N3T1 639 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CRYGNQ8WXF5 182 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 IL22Q9GZX6 179 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CD274Q9NZQ7 290 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PSMD13Q9UNM6 376 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TMEM114B3SHH9 223 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 KDM1AO60341 852 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 UGT1A9O60656 530 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PLIN5Q00G26 463 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PEX6Q13608 980 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 C1orf127Q8N9H9 656 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SLC25A23Q9BV35 468 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CDHR5Q9HBB8 845 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 RIC8BQ9NVN3 520 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CHD4Q14839 1912 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PLIN3O60664 434 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PCYT1AP49585 367 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 MRNIPQ6NTE8 343 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TSPAN14Q8NG11 270 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 KIF17Q9P2E2 1029 aa11□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PYGLP06737 847 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 NOS2P35228 1153 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 NR1H2P55055 460 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 UNC93AQ86WB7 457 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 WNT8BQ93098 351 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 OMDQ99983 421 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SYT11Q9BT88 431 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 EBF3Q9H4W6 596 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SETD4Q9NVD3 440 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 INPP4BO15327 924 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CLOCKO15516 846 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 BAIAP3O94812 1187 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ESRRBO95718 433 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 C2P06681 752 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PSME3P61289 254 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 EML3Q32P44 896 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PIGZQ86VD9 579 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ERO1BQ86YB8 467 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 SYT15Q9BQS2 421 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 RTKNQ9BST9 563 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 HES2Q9Y543 173 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.99□□□□□ -0.65
RAB18-201ENST00000356940 NUMBP49757 651 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms