RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP14Q86UN6 197 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DHFR2Q86XF0 187 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HIPK1Q86Z02 1210 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC185Q8N715 623 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RAD51CO43502 376 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PSMG1O95456 288 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DLGAP3O95886 979 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HMGCRP04035 888 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CYBBP04839 570 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RORAP35398 523 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 LHX1P48742 406 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 COX10Q12887 443 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AHI1Q8N157 1196 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MPP5Q8N3R9 675 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PJA1Q8NG27 643 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP42Q96MM3 310 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 WDR24Q96S15 920 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PKP3Q9Y446 797 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RIPK2O43353 540 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RGS14O43566 566 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CHP2O43745 196 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PROSCO94903 275 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FGF19O95750 216 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ENO1P06733 434 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HSF2Q03933 536 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ACCSLQ4AC99 568 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RASGEF1CQ8N431 466 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CRELD1Q96HD1 420 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINB11Q96P15 392 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM111AQ96PZ2 611 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PSMB7Q99436 277 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CLN6Q9NWW5 311 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ARL15Q9NXU5 204 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ENTPD5O75356 428 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP4AP20648 1035 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ALDH1A3P47895 512 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL9Q07325 125 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BLMHQ13867 455 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO42Q6P3S6 717 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 DPP10Q8N608 796 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 RFKQ969G6 155 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NSMCE2Q96MF7 247 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PIDD1Q9HB75 910 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 VTA1Q9NP79 307 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 COPZ2Q9P299 210 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PSMD13Q9UNM6 376 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 MRC1P22897 1456 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF862O60290 1169 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CSH1P0DML2 217 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 CSH2P0DML3 217 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SDC2P34741 201 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ASMTP46597 345 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 GNA12Q03113 381 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KCNMA1Q12791 1236 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFA9Q16795 377 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SPDYE2Q495Y8 402 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 HACD4Q5VWC8 232 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN14Q8NG11 270 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 OR56A4Q8NGH8 313 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 BTF3L4Q96K17 158 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 APOL6Q9BWW8 343 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL25Q9H0H3 589 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms