RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 STRADBQ9C0K7 418 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HACD3Q9P035 362 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT3Q9UH03 358 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ACACBO00763 2458 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVM2 712 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CTAGE9A4FU28 777 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A8MU76 341 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRR33A8MZF0 331 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK3O14649 394 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 COCHO43405 550 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA4FO95754 770 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-10P10266 1014 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DPP6P42658 865 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OR7D4Q8NG98 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G6Q8NH81 332 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf48Q96LL4 319 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RSPH14Q9UHP6 348 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC53A6NM62 1247 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 B4DGG1 531 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 APOL1O14791 398 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DCLK1O15075 740 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PAGE1O75459 146 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 VIPP01282 170 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SERPING1P05155 500 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY8P40145 1251 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CSKP41240 450 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CBX1P83916 185 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED6P86452 979 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BRD3Q15059 726 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TMED2Q15363 201 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NFIL3Q16649 462 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TERB1Q8NA31 727 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH5Q9NX47 278 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLF15Q9UIH9 416 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GGA2Q9UJY4 613 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNB2O15031 1838 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQC6 194 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MUSKO15146 869 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R37O75864 691 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF15O94989 841 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PCCBP05166 539 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MMEP08473 750 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RRM1P23921 792 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 USP45Q70EL2 814 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPR135Q8IZ08 494 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LZTR1Q8N653 840 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB124Q8NES8 71 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PLD4Q96BZ4 506 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CHFRQ96EP1 664 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CNPY3Q9BT09 278 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GAREM1Q9H706 876 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ACP6Q9NPH0 428 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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