RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCR1P32246 355 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LMNB2Q03252 620 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LRP8Q14114 963 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R5DQ14738 602 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RASA2Q15283 850 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R7Q15435 360 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TRADDQ15628 312 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TAF12Q16514 161 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DUPD1Q68J44 220 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LILRA6Q6PI73 481 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF276Q8N554 614 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ACTL9Q8TC94 416 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IFT81Q8WYA0 676 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SEC14L1Q92503 715 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 P3H4Q92791 437 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PSMG2Q969U7 264 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SAMD11Q96NU1 681 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LPXNO60711 386 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TBX18O95935 607 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ITGAVP06756 1048 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PCNAP12004 261 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AMPD1P23109 780 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HCAR3P49019 387 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CLCN4P51793 760 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NNTQ13423 1086 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PTK6Q13882 451 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DPYSQ14117 519 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NOMO1Q15155 1222 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 INAQ16352 499 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RFX8Q6ZV50 586 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ALLCQ8N6M5 410 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ASIC4Q96FT7 647 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A13Q96H72 371 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HAPLN3Q96S86 360 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DPH5Q9H2P9 285 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MCM8Q9UJA3 840 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 USP34Q70CQ2 3546 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 H0YC42 278 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GRM6O15303 877 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DAPK3O43293 454 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TLR5O60602 858 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC2A3P11169 496 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PPP3CCP48454 512 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CENPAP49450 140 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CUL1Q13616 776 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NEK5Q6P3R8 708 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ITIH5Q86UX2 942 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MCF2LO15068 1137 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PAGE1O75459 146 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IL33O95760 270 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GAS8O95995 478 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GLUD1P00367 558 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LRG1P02750 347 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TPI1P60174 286 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-21P61565 698 aa6.22□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TUBA1BP68363 451 aa6.22□□□□□ -1.41
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