RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 INAVAQ3KP66 663 aa21.79■■□□□ 1.08
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SOCS1-201ENST00000332029 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 CHSY1Q86X52 802 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.79■■□□□ 1.08
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SOCS1-201ENST00000332029 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.79■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
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SOCS1-201ENST00000332029 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.78■■□□□ 1.08
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SOCS1-201ENST00000332029 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.77■■□□□ 1.08
SOCS1-201ENST00000332029 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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SOCS1-201ENST00000332029 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.76■■□□□ 1.07
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SOCS1-201ENST00000332029 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.76■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 APCDD1Q8J025 514 aa21.76■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 GBP4Q96PP9 640 aa21.76■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.76■■□□□ 1.07
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SOCS1-201ENST00000332029 FAM149AA5PLN7 773 aa21.75■■□□□ 1.07
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SOCS1-201ENST00000332029 GRAP2O75791 330 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 ADH1BP00325 375 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 WNT1P04628 370 aa21.75■■□□□ 1.07
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SOCS1-201ENST00000332029 KCNJ12Q14500 433 aa21.75■■□□□ 1.07
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SOCS1-201ENST00000332029 STK40Q8N2I9 435 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 AADATQ8N5Z0 425 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 RNF34Q969K3 372 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 FAM129BQ96TA1 746 aa21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SOCS1-201ENST00000332029 COX16Q9P0S2 106 aa21.75■■□□□ 1.07
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