RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEAL3Q969E4 200 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAPLN3Q96S86 360 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBRSQ9HAH7 460 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNKQ9P0W0 207 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA1AO00555 2505 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC34A8MYJ7 566 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PAM4 449 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP5Z1O43299 807 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-19P01714 112 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ID4P47928 161 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPMTP51580 245 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARID5BQ14865 1188 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC31Q6UY01 552 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCEEQ96PE7 176 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP58Q9BVL2 599 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPP6Q9NZW5 540 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUN2Q9UH99 717 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUMA1Q14980 2115 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCP110O43303 1012 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDF9O60383 454 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIN3BO75182 1162 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKILP12757 684 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD6P30203 668 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB119Q8N690 84 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC185Q8N715 623 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGKQ92643 395 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PI4KAP42356 2102 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOCP08134 193 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITPKAP23677 461 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADRA1BP35368 520 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT2A1Q06520 285 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 MANEALQ5VSG8 457 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HGSNATQ68CP4 663 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NETO1Q8TDF5 533 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTAN1Q96AB6 310 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPY26PQ9H489 355 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS28Q9UK41 221 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PATE3B3GLJ2 98 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRGAP2O75044 1071 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACADMP11310 421 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 GZMAP12544 262 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGDHQ02218 1023 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF33AQ06730 810 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFKBIBQ15653 356 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT12Q8IV01 421 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCDQ96DY2 449 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB7Q99436 277 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms