RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 USP12O75317 370 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 FAM155BO75949 473 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SEC24AO95486 1093 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SOD2P04179 222 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CNTD1Q8N815 330 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1NQ8N819 430 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GSDMBQ8TAX9 411 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GDAP1Q8TB36 358 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TSGA13Q96PP4 275 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 MAFKO60675 156 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 AP2A1O95782 977 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TIMP1P01033 207 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 INHBAP08476 426 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 KRT4P19013 534 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CCNCP24863 283 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ARMC5Q96C12 935 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF558Q96NG5 402 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM51Q9NW97 253 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GSTA2P09210 222 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ACRP10323 421 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 DRD4P21917 467 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF33AQ06730 810 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM169Q96HH4 297 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UBP1Q9NZI7 540 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-27P01718 113 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CCNB1P14635 433 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ALFQ53S48 1182 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 AFMIDQ63HM1 303 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD11Q693B1 232 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC6Q86X45 466 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SYBUQ9NX95 663 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SHROOM3Q8TF72 1996 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 WASH4PA8MWX3 477 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A9O60656 530 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN5O94779 1100 aa23.28■■□□□ 1.32
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VSTM4-201ENST00000298454 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A7Q9HAW7 530 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A10Q9HAW8 530 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UGT1A8Q9HAW9 530 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TYROBPO43914 113 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 DSG1Q02413 1049 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL22Q6P050 247 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF8Q969P0 613 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 LTBP2Q14767 1821 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8RI6L899 631 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 EBAG9O00559 213 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ABLIM3O94929 683 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CSH1P0DML2 217 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CSH2P0DML3 217 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 FAM159BA6NKW6 160 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 MATN3O15232 486 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RAG1P15918 1043 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RHOQP17081 205 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 KCNQ1P51787 676 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 STEAP4Q687X5 459 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SGSM3Q96HU1 749 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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