RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 DFNA5O60443 496 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ADH1BP00325 375 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GLI1P08151 1106 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 C5AR1P21730 350 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CCR1P32246 355 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 KCNJ12Q14500 433 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PASD1Q8IV76 773 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SHC3Q92529 594 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.23■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GVM2 712 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 TNFSF14O43557 240 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 HSF2BPO75031 334 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GRAP2O75791 330 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 IL1BP01584 269 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 VAV1P15498 845 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GOT1P17174 413 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SULT2A1Q06520 285 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CAMK4Q16566 473 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL22Q6P050 247 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SKA1Q96BD8 255 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 LHX6Q9UPM6 363 aa20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GTQ1 180 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 C10orf142B7Z368 130 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 WNT1P04628 370 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PON1P27169 355 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CD38P28907 300 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CCR5P51681 352 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PLK1P53350 603 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ADPRHP54922 357 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 OXCT1P55809 520 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CENPCQ03188 943 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PTK2Q05397 1052 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 INAVAQ3KP66 663 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 NOX5Q96PH1 765 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SPEGQ15772 3267 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 KNL1Q8NG31 2342 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 WNT9AO14904 365 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 NME3Q13232 169 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC157Q569K6 752 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MDM1Q8TC05 714 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FRS2Q8WU20 508 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SPAG5Q96R06 1193 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ERBB2P04626 1255 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DRD3P35462 400 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 KRT9P35527 623 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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CXCL3-201ENST00000296026 ACCSLQ4AC99 568 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ALG14Q96F25 216 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SERAC1Q96JX3 654 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SIX2Q9NPC8 291 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.19■□□□□ 0.82
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