RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CERS2Q96G23 380 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 EGFL7Q9UHF1 273 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 VAPBO95292 243 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MT-ND1P03886 318 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CBX3Q13185 183 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MZB1Q8WU39 189 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LPAR1Q92633 364 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LACTBL1A8MY62 500 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MBLAC2Q68D91 279 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SNX25Q9H3E2 840 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 STK32BQ9NY57 414 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LTFP02788 710 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 C2P06681 752 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 STAG3L1P0CL83 205 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 VDRP11473 427 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 NR4A1P22736 598 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CNTFP26441 200 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 HSPA13P48723 471 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 UBR7Q8N806 425 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MFSD3Q96ES6 412 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 BTBD9Q96Q07 612 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.61■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 VWA5AO00534 786 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TSHRP16473 764 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SLC5A3P53794 718 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TRAF2Q12933 501 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PCLAFQ15004 111 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LY6KQ17RY6 165 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 IL23RQ5VWK5 629 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZNF276Q8N554 614 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 IPMKQ8NFU5 416 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 RDM1Q8NG50 284 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 URGCPQ8TCY9 931 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LRRC39Q96DD0 335 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 STK39Q9UEW8 545 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TMEM233B4DJY2 109 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 HDAC3O15379 428 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 OCM2P0CE71 109 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ENTPD1P49961 510 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZNF460Q14592 562 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 POU6F1Q14863 301 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 RTKNQ9BST9 563 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SELENONQ9NZV5 590 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PHF24Q9UPV7 400 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 81.3
USP25-201ENST00000285679 A0A0J9YVX5 310 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ADGRE1Q14246 886 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CSHL1Q14406 222 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 PCSK7Q16549 785 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 TBCELQ5QJ74 424 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 DRC3Q9H069 523 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 GMNNO75496 209 aa15.6■□□□□ 0.09
USP25-201ENST00000285679 CLIC3O95833 236 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms