RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NXNL1Q96CM4 212 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 HGH1Q9BTY7 390 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 MND1Q9BWT6 205 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DEPDC5O75140 1603 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PEX11AO75192 247 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GJB6O95452 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RBP3P10745 1247 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 VDRP11473 427 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 MAGP20916 626 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TNK2Q07912 1038 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM32Q13049 653 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PTPAQ15257 358 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ALLCQ8N6M5 410 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RSAD1Q9HA92 442 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FAM172BPA6NC97 362 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 STMND1H3BQB6 276 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CRYZL1O95825 349 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 LSAMPQ13449 338 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DGKDQ16760 1214 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CA9Q16790 459 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 REEP2Q9BRK0 252 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 KCNQ2O43526 872 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ICAM1P05362 532 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ITGALP20701 1170 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CPT1AP50416 773 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NCOA4Q13772 614 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 MOGQ16653 247 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TMCO6Q96DC7 493 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 C5orf58C9J3I9 102 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 KBTBD13C9JR72 458 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 IFNA7P01567 189 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 F8A1P23610 371 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TP53INP1Q96A56 240 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CPS1P31327 1500 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2QL1A1L167 161 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CTDNEP1O95476 244 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINA1P01009 418 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ECT2LQ008S8 904 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA18Q8TC71 538 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 H7C2Y5 167 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PDPK1O15530 556 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN19P0C672 248 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ATP12AP54707 1039 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 TPI1P60174 286 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 EMC1Q8N766 993 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GMCL1Q96IK5 515 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 KPNA6O60684 536 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 IL32P24001 234 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 HM13Q8TCT9 377 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3R3Q92569 461 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 EGFL8Q99944 293 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 CPVLQ9H3G5 476 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-201ENST00000281171 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms