RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267488.8

SLC38A6-201, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC38A6, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-201ENST00000267488 EBF3Q9H4W6 596 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-201ENST00000267488 ECT2Q9H8V3 914 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-201ENST00000267488 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-201ENST00000267488 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-201ENST00000267488 RAD54BQ9Y620 910 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ATP8B1O43520 1251 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TUBBP07437 444 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ADH5P11766 374 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 OR1E1P30953 314 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NDST2P52849 883 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 OXCT1P55809 520 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 RUNX3Q13761 415 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ANO4Q32M45 955 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 BRD9Q9H8M2 597 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 HPS4Q9NQG7 708 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 F5P12259 2224 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 H0Y626 953 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ARNTLO00327 626 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TYRP14679 529 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ARSAP15289 507 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 DYNLT1P63172 113 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 BRD3Q15059 726 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 MFN1Q8IWA4 741 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 FIBINQ8TAL6 211 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 P3H4Q92791 437 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 P2RY11Q96G91 374 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 KLC2Q9H0B6 622 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ILVBLA1L0T0 632 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NCAM2O15394 837 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CACNG3O60359 315 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CDH18Q13634 790 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 AFMIDQ63HM1 303 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NPWQ8N729 165 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 BHMTQ93088 406 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 MAGEH1Q9H213 219 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 PLK2Q9NYY3 685 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 FBXO10Q9UK96 956 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 RAB21Q9UL25 225 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CCDC151A5D8V7 595 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 MFSD11O43934 449 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ETFBP38117 255 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ZP2Q05996 745 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TNK2Q07912 1038 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC12A1Q13621 1099 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 PARP15Q460N3 678 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 DNASE1L2Q92874 299 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 EPC1Q9H2F5 836 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 LRRC19Q9H756 370 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 DTLQ9NZJ0 730 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 RAMP2O60895 175 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 RHOCP08134 193 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 MX2P20592 715 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 GNA12Q03113 381 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 GBE1Q04446 702 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 XRCC4Q13426 336 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 TDGQ13569 410 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 NOMO1Q15155 1222 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-201ENST00000267488 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms