RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF570Q96NI8 536 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TWNKQ96RR1 684 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 NACA2Q9H009 215 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 AP2A1O95782 977 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PROCP04070 461 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 THP07101 528 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CSH1P0DML2 217 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CSH2P0DML3 217 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 RAG1P15918 1043 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 LIPMQ5VYY2 423 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 AGR3Q8TD06 166 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 ASB2Q96Q27 587 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 GID8Q9NWU2 228 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 SUN2Q9UH99 717 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.03□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 AOC1P19801 751 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 PSEN2P49810 448 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 Q3C1V9 767 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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HERC3-201ENST00000264345 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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HERC3-201ENST00000264345 HDAC3O15379 428 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 MFSD11O43934 449 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 PIAS1O75925 651 aa9.02□□□□□ -0.97
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HERC3-201ENST00000264345 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.02□□□□□ -0.97
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HERC3-201ENST00000264345 GRIK1P39086 918 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 ACTR3P61158 418 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 NAA20P61599 178 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A3Q00325 362 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 NTAN1Q96AB6 310 aa9.02□□□□□ -0.97
HERC3-201ENST00000264345 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.02□□□□□ -0.97
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