RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PGAM5Q96HS1 289 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 C1orf74Q96LT6 269 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PPE2 198 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PR64 198 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 KCNJ18B7U540 433 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A3O75751 556 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PRR35P0CG20 571 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 THEGLP0DJG4 465 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PRPH2P23942 346 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CD86P42081 329 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 DYRK1AQ13627 763 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ST3GAL2Q16842 350 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 METTL24Q5JXM2 366 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GJB7Q6PEY0 223 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 IYDQ6PHW0 289 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 RAPH1Q70E73 1250 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GALNT7Q86SF2 657 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 KBTBD6Q86V97 674 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 NEK9Q8TD19 979 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SYT17Q9BSW7 474 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PEMTQ9UBM1 199 aa6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PS29 197 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 FFAR3O14843 346 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GPR42O15529 346 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SPRY2O43597 315 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TACC1O75410 805 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 KAT7O95251 611 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 HLA-DOAP06340 250 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CHRM4P08173 479 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 MMP8P22894 467 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PTAFRP25105 342 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PMS2P54278 862 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CAMK2DQ13557 499 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PARP10Q53GL7 1025 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ODF2Q5BJF6 829 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 METTL23Q86XA0 190 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GLMPQ8WWB7 406 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 KCNJ9Q92806 393 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 GCM1Q9NP62 436 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 FBXL17Q9UF56 701 aa6.35□□□□□ -1.39
MDM2-201ENST00000258148 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms