RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248948.3

VPREB3-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB3, Length 610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3-201ENST00000248948 C6orf118Q5T5N4 469 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MANEALQ5VSG8 457 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF783Q6ZMS7 281 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 C14orf80Q86SX3 495 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 DCLK2Q8N568 766 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 DCAF4L2Q8NA75 395 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SUN2Q9UH99 717 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.14□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TMCO5BA8MYB1 307 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RHOCP08134 193 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 HLA-EP13747 358 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ADRA1BP35368 520 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 HOXD12P35452 270 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 NNMTP40261 264 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SPEM2Q0P670 501 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MAMLD1Q13495 774 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ALFQ53S48 1182 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PLA2G2CQ5R387 149 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ARTNQ5T4W7 220 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TMPRSS6Q8IU80 811 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 APCDD1Q8J025 514 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RNF214Q8ND24 703 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RLN3Q8WXF3 142 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF653Q96CK0 615 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ALG14Q96F25 216 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ISCUQ9H1K1 167 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 VPS45Q9NRW7 570 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 VPS28Q9UK41 221 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 USP18Q9UMW8 372 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 NEU3Q9UQ49 428 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 OR51B4Q9Y5P0 310 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PI4KAP42356 2102 aa13.13□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MAP3K13O43283 966 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CNTN5O94779 1100 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 FTLP02792 175 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ACADMP11310 421 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SKILP12757 684 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CD6P30203 668 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 OXTRP30559 389 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CASP14P31944 242 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ETFBP38117 255 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MAPKAPK2P49137 400 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 EFHC2Q5JST6 749 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SARM1Q6SZW1 724 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TMC6Q7Z403 805 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 VSTM4Q8IW00 320 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 DRC7Q8IY82 874 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 CCDC185Q8N715 623 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF366Q8N895 744 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 MUC3BQ9H195 1237 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.12□□□□□ -0.31
VPREB3-201ENST00000248948 OR12D3Q9UGF7 316 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms