RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 CYP2A13Q16696 494 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 ZNF621Q6ZSS3 439 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 KLHL23Q8NBE8 558 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 NEK7Q8TDX7 302 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 RUBCNQ92622 972 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.71□□□□□ -0.21
TMX4-201ENST00000246024 ANKDD1BA6NHY2 528 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TLL1O43897 1013 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 AQP5P55064 265 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PARGQ86W56 976 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 USP38Q8NB14 1042 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TMEM176AQ96HP8 235 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ZIM3Q96PE6 472 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 EHD4Q9H223 541 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CHKBQ9Y259 395 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 A0A1B0GTH6 734 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CD52P31358 61 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TBCELQ5QJ74 424 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC30A9Q6PML9 568 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 RAD9BQ6WBX8 426 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 RPTNQ6XPR3 784 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PROSER1Q86XN7 944 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PROX1Q92786 737 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 VPS45Q9NRW7 570 aa13.71□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 UBDO15205 165 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 IL6P05231 212 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CPA3P15088 417 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 VHLP40337 213 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CLK3P49761 638 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 NDUFV1P49821 464 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 BMPR2Q13873 1038 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 EML3Q32P44 896 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 DET1Q7L5Y6 550 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 MILR1Q7Z6M3 343 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FAM124AQ86V42 546 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FBXO39Q8N4B4 442 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 REPS1Q96D71 796 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 OR10H1Q9Y4A9 318 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CYP2F1P24903 491 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 MYL12BO14950 172 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PLSCR1O15162 318 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CLUP10909 449 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SNAP47Q5SQN1 464 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 HAO1Q9UJM8 370 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ZBTB14O43829 449 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 TSPAN19P0C672 248 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 NFKB1P19838 968 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PPIL2Q13356 520 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CXorf40BQ96DE9 158 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 GANQ9H2C0 597 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC26A4O43511 780 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 OR10H2O60403 315 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 GYPCP04921 128 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 LSP1P33241 339 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 ALG11Q2TAA5 492 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 PDPK2PQ6A1A2 396 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FAM171BQ6P995 826 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 SMYD1Q8NB12 490 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 FANCEQ9HB96 536 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CYLDQ9NQC7 956 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 GTF3C4Q9UKN8 822 aa13.7□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.69□□□□□ -0.22
TMX4-201ENST00000246024 KPNA6O60684 536 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms