RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 AIF1P55008 147 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ACAP1Q15027 740 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 H2AFVQ71UI9 128 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PANX2Q96RD6 677 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PSMB7Q99436 277 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TMEM253P0C7T8 217 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 IL1R2P27930 398 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CDC25BP30305 580 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF366Q8N895 744 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 EPC1Q9H2F5 836 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 FRYLO94915 3013 aa22.9■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 A0A0D9SEW6 157 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 RNF8O76064 485 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 LCA5LO95447 670 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ASLP04424 464 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 C7P10643 843 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 RHOQP17081 205 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PCK1P35558 622 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 COPAP53621 1224 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 OXCT1P55809 520 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ECT2LQ008S8 904 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 EFHC2Q5JST6 749 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 KDM1BQ8NB78 822 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 HMGB4Q8WW32 186 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 FAM122AQ96E09 287 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 MTG2Q9H4K7 406 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.89■■□□□ 1.26
SYF2-201ENST00000236273 MOCS3O95396 460 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 EPHX1P07099 455 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 NDUFV2P19404 249 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 OR1E1P30953 314 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CNR2P34972 360 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 E2F5Q15329 346 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 USP18Q9UMW8 372 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.88■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ILVBLA1L0T0 632 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ALDH1A2O94788 518 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RHOCP08134 193 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 OR7D4Q8NG98 312 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 GAB3Q8WWW8 586 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.87■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 WASH4PA8MWX3 477 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TTC34A8MYJ7 566 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MYO1FO00160 1098 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 DCLK1O15075 740 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PRPSAP2O60256 369 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SNAP91O60641 907 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 DESP17661 470 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SULT2A1Q06520 285 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TMEM139Q8IV31 216 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 FRMD1Q8N878 549 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms