RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224807.9

SFXN3-201, Transcript of sideroflexin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SFXN3, Length 3,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3-201ENST00000224807 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 ME2P23368 584 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 PRKCHP24723 683 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 NR1H2P55055 460 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 CARTPTQ16568 116 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 ARCQ7LC44 396 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 USP33Q8TEY7 942 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 STK39Q9UEW8 545 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.65□□□□□ -0.06
SFXN3-201ENST00000224807 A0A1W2PPW3 197 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 RGS20O76081 388 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 VAPBO95292 243 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 PRKCBP05771 671 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 NPR1P16066 1061 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CASP2P42575 452 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 VPS72Q15906 364 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 XKR3Q5GH77 459 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZNF280DQ6N043 979 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 POTEAQ6S8J7 498 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZNF534Q76KX8 674 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CDH19Q9H159 772 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 FAM159BA6NKW6 160 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ALDH1B1P30837 517 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 BNIP3Q12983 259 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 PLCL1Q15111 1095 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GEN1Q17RS7 908 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 POTEHQ6S545 545 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 BTBD9Q96Q07 612 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 MED7O43513 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ENTPD3O75355 529 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 FAM163BP0C2L3 166 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GRIA4P48058 902 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CLCN3P51790 818 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 NDST1P52848 882 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 EMP3P54852 163 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 STYK1Q6J9G0 422 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 NUP93Q8N1F7 819 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CNPY3Q9BT09 278 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 USP21Q9UK80 565 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.64□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 BIRC5O15392 142 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 IL4RP24394 825 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SERPINB9P50453 376 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZNF132P52740 706 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 AKT1S1Q96B36 256 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CPB2Q96IY4 423 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 YDJCA8MPS7 323 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 KCNH1O95259 989 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 MCF2P10911 925 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 COL6A2P12110 1019 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 PTGER2P43116 358 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 GNA12Q03113 381 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 CCDC14Q49A88 953 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 PMF1Q6P1K2 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 C16orf89Q6UX73 402 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.63□□□□□ -0.07
SFXN3-201ENST00000224807 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms